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16sDNA簡介及其應用于細菌鑒定的優點

時間:2017-4-10閱讀:1668
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近年來,基于pcr擴增的基因診斷技術備受青睞,細菌核糖體16S小亞基基因(16SrDNA)鑒定引起了科研人員的廣泛關注。

16S rDNA是細菌的系統分類研究中zui有用的和zui常用的分子鐘,其種類少,含量大(約占細菌RNA含量的80%),分子大小適中,存在于所有的生物中,其進化具有良好的時鐘性質,在結構與功能上具有高度的保守性,素有“細菌化石”之稱。

在大多數原核生物中rDNA都具有多個拷貝,5S、16S、23S rDNA的拷貝數相同。16S rDNA由于大小適中,約1.5Kb左右,既能體現不同菌屬之間的差異,又能利用測序技術較容易地得到其序列,故被細菌學家和分類學家接受。

在細菌基因組中, 編碼16S rRNA 的 rDNA 基因具有良好的進化保守性, 適宜分析的長度( 約為 1 5kb), 以及與進化距離相匹配的良好變異性,所以成為細菌分子鑒定的標準標識序列。目前 16SrDNA 的序列信息已經廣泛應用于菌種鑒定和系統發生學研究。那么,利用16SrDNA進行細菌鑒定有哪些優點呢?

1、16S rRNA 普遍存在于原核生物中。rRNA 參與生物蛋白質的合成過程,其功能是任何生物都*的,而且在生物進化的漫長歷程中保持不變,可看作為生物演變的時間鐘。

2、在 16S rRNA 分子中,既含有高度保守的序列區域,又有中度保守和高度變化的序列區域,因而它適用于進化距離不同的各類生物親緣關系的研究。

3、16S rRNA 的相對分子量大小適中,約1540 個核苷酸,便于序列分析。

4、可變區序列因細菌不同而異,恒定區序列基本保守,所以可利用恒定區序列設計引物,將16S rDNA片段擴增出來,利用可變區序列的差異來對不同菌屬、菌種的細菌進行分類鑒定。

由上可知,細菌核糖體16S小亞基基因(16SrDNA)鑒定擁有其他類似技術不能比擬的優勢,16S rDNA的潛力不容忽視,我們可以預見,未來這一技術將在各個生物領域大有可為。

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